Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRAP54198 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRAP54198 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms