Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HK3P52790 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HK3P52790 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HK3P52790 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HK3P52790 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HK3P52790 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HK3P52790 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HK3P52790 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HK3P52790 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HK3P52790 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HK3P52790 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms