Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMSP52788 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMSP52788 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMSP52788 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMSP52788 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms