Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAMP50895 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAMP50895 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAMP50895 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms