Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME1P48163 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME1P48163 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME1P48163 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME1P48163 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms