Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCR1P46094 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCR1P46094 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms