Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA3P43357 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms