Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms