Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DDIT3P35638 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms