Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms