Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms