Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPC1P35052 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC1P35052 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms