Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF4P34130 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NTF4P34130 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF4P34130 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms