Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF1P30408 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms