Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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