Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms