Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHCGRP22888 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms