Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM21P19474 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms