Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD46P15529 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD46P15529 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms