Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL2P13500 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL2P13500 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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