Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms