Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSF2P04141 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms