Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL3A1P02461 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL3A1P02461 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL3A1P02461 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL3A1P02461 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL3A1P02461 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms