Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUBNO60494 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUBNO60494 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUBNO60494 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CUBNO60494 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CUBNO60494 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CUBNO60494 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CUBNO60494 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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