Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP10AO60312 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms