Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms