Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms