Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms