Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIP1O00291 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIP1O00291 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIP1O00291 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms