Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KR12 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KR12 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KR12 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms