Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN34H7C241 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms