Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E9PBE3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E9PBE3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E9PBE3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms