Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NL46 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NL46 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NL46 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms