Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms