Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms