Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms