Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms