Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms