Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms