Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms