Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms