Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms