Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms