Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms