Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms