Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms