Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.463e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAEA-210ENST00000508634 694 ntTSL 217.91■□□□□ 0.463e-12■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.465e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.453e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-204ENST00000561658 556 ntTSL 417.88■□□□□ 0.453e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLEKHH3-209ENST00000592974 628 ntTSL 317.72■□□□□ 0.435e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 HINFP-214ENST00000532860 968 ntTSL 217.61■□□□□ 0.415e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.45e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.45e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.43e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-202ENST00000395549 937 ntTSL 517.51■□□□□ 0.395e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SCARF1-203ENST00000434376 3342 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.385e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPP2R3B-207ENST00000477636 519 ntTSL 517.13■□□□□ 0.333e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-208ENST00000411953 582 ntTSL 517.09■□□□□ 0.335e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-229ENST00000582547 600 ntTSL 417.04■□□□□ 0.325e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.323e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-217ENST00000530942 552 ntTSL 416.95■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 EPN2-226ENST00000584954 535 nt16.88■□□□□ 0.293e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-214ENST00000549774 847 ntTSL 516.84■□□□□ 0.293e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-227ENST00000581416 741 ntTSL 316.82■□□□□ 0.285e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-205ENST00000561852 768 ntTSL 316.74■□□□□ 0.273e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-205ENST00000469827 586 ntTSL 216.71■□□□□ 0.273e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.255e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.245e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-222ENST00000534610 1655 ntTSL 516.54■□□□□ 0.245e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-219ENST00000456808 741 ntTSL 416.52■□□□□ 0.245e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-206ENST00000563064 1048 ntTSL 316.31■□□□□ 0.23e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MYO18A-215ENST00000533399 336 ntTSL 316.3■□□□□ 0.23e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.173e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-214ENST00000579392 483 ntTSL 416.11■□□□□ 0.173e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-218ENST00000581713 585 ntTSL 316.11■□□□□ 0.173e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-207ENST00000490457 916 ntTSL 316.07■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.165e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SLC22A18-204ENST00000441077 831 ntTSL 516.03■□□□□ 0.163e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-215ENST00000601876 580 ntTSL 315.9■□□□□ 0.145e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SCARF1-209ENST00000576012 3292 ntTSL 215.86■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-207ENST00000479945 4459 ntTSL 215.83■□□□□ 0.133e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-210ENST00000578536 784 ntTSL 515.79■□□□□ 0.123e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 GGNBP2-215ENST00000617860 3497 ntTSL 215.78■□□□□ 0.123e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TAF10-203ENST00000531760 502 ntTSL 515.76■□□□□ 0.115e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SWI5-202ENST00000372898 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.68■□□□□ 0.13e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-214ENST00000435234 1047 ntTSL 315.67■□□□□ 0.15e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-208ENST00000564191 853 ntTSL 315.64■□□□□ 0.093e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PUF60-206ENST00000526151 557 ntTSL 315.59■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.093e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MGST1-218ENST00000543076 406 ntTSL 315.41■□□□□ 0.063e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SLC22A18-212ENST00000498209 782 ntTSL 315.24■□□□□ 0.033e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-219ENST00000552202 1290 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.033e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 VPS37B-204ENST00000543590 1457 ntTSL 315.2■□□□□ 0.023e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-202ENST00000383714 1478 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.013e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 03e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.013e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-204ENST00000469364 1616 ntTSL 514.94□□□□□ -0.023e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-210ENST00000597107 842 ntTSL 514.93□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-217ENST00000445378 566 ntTSL 414.87□□□□□ -0.035e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TAF10-205ENST00000616342 5392 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPP2R3B-204ENST00000468169 713 ntTSL 314.74□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-216ENST00000580578 577 ntTSL 414.73□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ARMT1-203ENST00000494826 712 ntTSL 214.7□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-211ENST00000598875 563 ntTSL 214.66□□□□□ -0.065e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.075e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SH3BP1-208ENST00000495174 947 ntTSL 514.57□□□□□ -0.083e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-217ENST00000580925 204 ntTSL 314.52□□□□□ -0.093e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-215ENST00000550535 770 ntTSL 314.26□□□□□ -0.133e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-218ENST00000551723 415 ntTSL 514.2□□□□□ -0.143e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 APBA3-204ENST00000589934 725 ntTSL 214.19□□□□□ -0.143e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.143e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-212ENST00000599546 740 ntTSL 314.12□□□□□ -0.155e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MED27-203ENST00000444872 433 ntTSL 513.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-207ENST00000593939 897 ntTSL 313.82□□□□□ -0.25e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-221ENST00000533325 1021 ntTSL 513.8□□□□□ -0.25e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NLRP2-212ENST00000540597 3744 ntTSL 213.79□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.215e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-220ENST00000552429 560 ntTSL 213.69□□□□□ -0.223e-13■■■■■ 167.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1049.9 ms