Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms