Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms