Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROBO2Q9HCK4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ROBO2Q9HCK4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms